Ο Ύσσωπος έχει ένα ενδιαφέρον φάσμα εφαρμογών, οι οποίες οφείλονται σε μεγάλο βαθμό στην αντισπασμωδική δράση του πτητικού ελαίου που περιέχει. Χρησιμοποιείται για τη βρογχίτιδα, το βήχα και τη χρόνια καταρροή. Οι εφιδρωτικές του ιδιότητες τον κάνουν ωφέλιμο για το κοινό κρυολόγημα. Ως νευρωτονωτικό μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε καταστάσεις ανησυχίας, υστερίας, και μικρής επιληψίας.