Το θυμάρι είναι εξαιρετικό ίαμα για τον βήχα, γιατί προκαλεί απόχρεμψη και μειώνει τους περιττούς σπασμούς. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί στη βρογχίτιδα, τον κοκκύτη και το άσθμα. Χρησιμοποιείται ακόμη για γαργαρισμούς στη λαρυγγίτιδα και αμυγδαλίτιδα, καταπραΰνοντας τον ερεθισμένο λαιμό και τον ερεθιστικό βήχα. Λόγω της ήπιας στυπτικής του δράσης, είναι χρήσιμο στην παιδική διάρροια και τη νυχτερινή ενούρηση.