Όταν η στομαχική διαταραχή μεταβάλλεται από λειτουργική, όπως είναι η δυσπεψία, σε δομική, το πρώτο στάδιο είναι η φλεγμονή ου βλεννογόνου των τοιχωμάτων του στομάχου. Αυτό μπορεί να διαρκέσει για λίγο μόνο και να οφείλεται σε λοίμωξη ή σε αντίδραση σε κάποια τροφή, ή μπορεί να γίνει χρόνιο. Τα αίτια που πρέπει να αναζητήσουμε είναι : ανθυγιεινές τροφές, αλκοόλ, κάπνισμα και το στρες. Συνήθως εμπλέκεται ένας συνδυασμός από αυτούς τους παράγοντες. Ένας συνδυασμός βοτάνων που θα μπορούσε να βοηθήσει (αν η φλεγμονή συνοδεύεται από τυμπανισμό) στην θεραπεία της γαστρίτιδας είναι ο ακόλουθος: